192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1758 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  35.78 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  22.52 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  20.55 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  36.36 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  22.91 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  24.04 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>