More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5705 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  47.18 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.29 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  38.64 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 198 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 185 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  43.84 
 
 		 340 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>