More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0096 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 217 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 187 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 280 aa  263  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.15 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.15 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  24.53 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  25.4 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  27.27 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  37.18 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>