More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6809 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  52.08 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 446 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  34.74 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 451 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 451 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 428 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 245 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  39.29 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 204 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  28.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>