More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4037 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 446 aa  899    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 497 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 211 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 199 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 199 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 199 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 207 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 178 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 183 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.95 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  25.42 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 218 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 198 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 212 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 213 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 232 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 221 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 192 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 223 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 204 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 202 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 213 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 196 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 209 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  30.71 
 
 		 212 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 261 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  41.82 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 181 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 190 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.51 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 190 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 199 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 186 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 202 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 201 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 236 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>