More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5790 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
248 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
335 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 
291 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 
268 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.14 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.78 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  40.85 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
192 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
330 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.82 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
446 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  26.04 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  41.67 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
198 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>