More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0906 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  43.56 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  48.34 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 291 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  34.88 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  39.34 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.67 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>