More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4813 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  93.33 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.42 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  25.25 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.94 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  22.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>