More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7959 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  64.48 
 
 		 188 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  32.61 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  20.47 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 424 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.86 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  36 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>