211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2924 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  33.73 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  33.13 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.72 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  22.96 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  24.32 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>