218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3009 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 194 aa  292  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 194 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 194 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 194 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  65.41 
 
 		 194 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  36.65 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  38.38 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  32.39 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  21.72 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  24.86 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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