240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10198 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  42.47 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  36.61 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 186 aa  89  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.41 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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