166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6284 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  53.26 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  38.42 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 194 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 191 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  25.58 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>