105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2958 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  34.27 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 194 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.05 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 191 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 191 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  22.7 
 
 		 193 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>