173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3489 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  55.98 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  38.86 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  38.46 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  32.61 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  22.05 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  47.46 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 374 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  42.86 
 
 		 240 aa  44.7  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.09 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  19.65 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  35.05 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>