256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2764 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 194 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 194 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  64.86 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  47.72 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  41.8 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  38.34 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  38.3 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  31.18 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.37 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  21.59 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  21.59 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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