More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3185 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  30.29 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  26.9 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  27.54 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  27.33 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  22.96 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.81 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  27.54 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  35.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>