284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4133 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 209 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  32.07 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  32.97 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  34.22 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.51 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  26.59 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  26.26 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  22.16 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  21.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>