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for query gene Smal_2003 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  77.96 
 
 
189 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  75.94 
 
 
189 aa  300  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  72.58 
 
 
189 aa  283  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  70.49 
 
 
188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 
188 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 
197 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 
221 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  49.13 
 
 
205 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
221 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
205 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 
210 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
204 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
204 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
201 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
201 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
201 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
201 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
192 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
190 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
195 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  38.8 
 
 
185 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 
188 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 
179 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 
188 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
203 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
257 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
192 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
184 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
193 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
202 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
222 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
196 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
187 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
191 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
194 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.56 
 
 
181 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
181 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
204 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
202 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
194 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
181 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
197 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
197 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
207 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
210 aa  94.4  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  35.23 
 
 
216 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
215 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
178 aa  92  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  31.84 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 
211 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  29.78 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  29.57 
 
 
193 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  30.94 
 
 
225 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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