More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3995 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  96.88 
 
 		 169 aa  292  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 202 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  53.71 
 
 		 178 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  56.73 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  54.75 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 188 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  46.33 
 
 		 181 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 196 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 196 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 189 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 203 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 191 aa  94.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 		 191 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 185 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 190 aa  89  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 197 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 192 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 198 aa  85.1  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 192 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 188 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 188 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>