More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1371 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  89.89 
 
 		 189 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  78.19 
 
 		 189 aa  314  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  77.96 
 
 		 189 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  75.4 
 
 		 194 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  63.84 
 
 		 188 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 201 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 225 aa  94.4  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.11 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>