More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001160 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 181 aa  257  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 204 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 204 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 204 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 221 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.66 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 222 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.9 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  43.55 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
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NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
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NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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