More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2816 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  50.4 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  50.4 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.94 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  39.39 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  34.81 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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