More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2510 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  65.19 
 
 		 181 aa  257  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 202 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 204 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 203 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  90.9  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 195 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 190 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.45 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
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NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
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