More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5689 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  424  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  58.29 
 
 		 181 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  46.99 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  51.7 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 178 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  45.24 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  47.98 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 179 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 189 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 186 aa  98.2  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 189 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 203 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.17 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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