More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13194 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 196 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  39.23 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 186 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 178 aa  88.6  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  38.65 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
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NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
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NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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