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for query gene Smed_4442 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 
189 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  46.33 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
176 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
197 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
196 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
202 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 
185 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 
203 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
191 aa  104  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
206 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 
185 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
200 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
207 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
206 aa  94.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
215 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
218 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
214 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
211 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  34.18 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.35 
 
 
216 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
186 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
213 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
213 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 
201 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
187 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
189 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
181 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  43.8 
 
 
234 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
175 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
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