More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1305 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  42.94 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 204 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 221 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 196 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 257 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 198 aa  97.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 211 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 200 aa  90.9  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 222 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 207 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.9 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 216 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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