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for query gene BamMC406_3117 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  99.02 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  92.04 
 
 
201 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  91.54 
 
 
201 aa  344  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  91.54 
 
 
201 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  91.04 
 
 
201 aa  341  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  86.89 
 
 
208 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  76.88 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  76.14 
 
 
205 aa  279  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 
221 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  69.89 
 
 
221 aa  254  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  71 
 
 
210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  52.36 
 
 
197 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
194 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
188 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 
189 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 
189 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 
189 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
200 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
200 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 
190 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
201 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
201 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
257 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
195 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
195 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 
185 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
196 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
194 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
191 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
197 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  38.42 
 
 
191 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
181 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
205 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
185 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 
204 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
210 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
204 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
222 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 
178 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
181 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
202 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
211 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
203 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
202 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 
197 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  37.41 
 
 
181 aa  98.2  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  32.8 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 
234 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
193 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
192 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
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NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
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NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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