More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2884 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  98.02 
 
 
202 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  93.56 
 
 
202 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 
204 aa  314  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 
204 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  73.13 
 
 
205 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
184 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
185 aa  171  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 
194 aa  160  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  42.77 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
181 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 
185 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
200 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
194 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
179 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
189 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
189 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
189 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
190 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
192 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 
201 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
207 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 
201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
196 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
192 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
188 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  33.15 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
204 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
211 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
204 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
205 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
206 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
206 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.14 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
234 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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