More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8687 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
176 aa  352  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
192 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 
187 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
206 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  43.12 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 
191 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
179 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 
190 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
203 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 
191 aa  94.4  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
181 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 
204 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
222 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
217 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
196 aa  90.9  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  37.34 
 
 
216 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  40 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
201 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 
174 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
197 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
196 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
215 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
209 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
218 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
213 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
206 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
213 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
207 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
216 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  35.22 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
202 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
212 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
234 aa  77.4  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  32.3 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
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NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
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NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
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NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
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