More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1985 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  74.87 
 
 		 194 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  72.63 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  74.44 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  35.26 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
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