More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5133 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.02 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  32.4 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 181 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  43.56 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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