More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3701 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3536  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0732  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  decreased coverage  0.00650584 
 
 
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NC_010465  YPK_3832  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3685  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  33.73 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3411  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4683  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4718  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172421  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4592  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.315374 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4600  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4740  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.76084  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_0721  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4604  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000800065  normal  0.777869 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0402  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314976  normal  0.0133648 
 
 
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NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_04005  predicted transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3857  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03967  hypothetical protein  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A4376  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00211026  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3877  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.859498  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4664  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0502  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5651  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000374909  normal  0.719853 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4690  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0322  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306279 
 
 
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NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
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