More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2965 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  353  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  54.97 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 195 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 194 aa  97.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 203 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 208 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 198 aa  88.6  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 194 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 234 aa  87.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 196 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  30.22 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
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NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
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NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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