More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0250 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  99 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  98 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 221 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  44.13 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 189 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  39.66 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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