More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5419 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 200 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 200 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 187 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 188 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 205 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 201 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 189 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 192 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 179 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 186 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 183 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 194 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 202 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 201 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 203 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 197 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 185 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 201 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 207 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 192 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 191 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 185 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 189 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 178 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  31.94 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.75 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 197 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 185 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  32.78 
 
 		 193 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>