More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0306 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  88.11 
 
 		 201 aa  314  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 214 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 206 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  51.5 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 203 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 187 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 228 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
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NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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