More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3533 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  91.13 
 
 		 216 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 215 aa  267  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 214 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 214 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 206 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 206 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 207 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 207 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  58.2 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  46.29 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 186 aa  94.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 194 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 191 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  33.74 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>