More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5107 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 186 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  34.76 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  26.53 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
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NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
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NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
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NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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