More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5341 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  57.38 
 
 
179 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  55.76 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
200 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 
189 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
188 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
188 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
194 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
190 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  49.66 
 
 
191 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
215 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 
201 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
203 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
202 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 
185 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  39.55 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 
201 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
188 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
188 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
187 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
197 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
202 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 
219 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
207 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
196 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
190 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
218 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
222 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 
221 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
216 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
191 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
206 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
206 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
206 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
186 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
187 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
208 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
201 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
197 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
197 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
201 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
189 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
201 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
196 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
257 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
193 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
181 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
192 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  42.04 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
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NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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