More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3262 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 203 aa  217  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  53.59 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 196 aa  180  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 257 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  48.18 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 202 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 203 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 181 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  36 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>