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for query gene Dfer_0803 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
174 aa  356  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
175 aa  225  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  53.8 
 
 
179 aa  190  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 
186 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
196 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
188 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
192 aa  95.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
195 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
211 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  30.34 
 
 
198 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 
176 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
189 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
221 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.39 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
195 aa  87.8  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 
190 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
210 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
194 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
192 aa  84.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 
201 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
191 aa  84  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 
234 aa  80.9  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
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NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
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NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
222 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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