More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0474 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 197 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  60.68 
 
 		 196 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 198 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 192 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 194 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 187 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 178 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 181 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 191 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 181 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 175 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 185 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 188 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 188 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  37.8 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>