More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3878 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
197 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  42.33 
 
 
198 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
222 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
207 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  47.93 
 
 
196 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
215 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
202 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 
211 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
187 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 
189 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  38.14 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
218 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
203 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
195 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
206 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
195 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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