More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7147 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  53.8 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  46.33 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 211 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  28.49 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  29.28 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.43 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
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