More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5016 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
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NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
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NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
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NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
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NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
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NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  29.41 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  30.72 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.69 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.95 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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