More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3406 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 228 aa  85.5  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
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NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  27.06 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
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NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  29.45 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
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