More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4955 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  48.82 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  48.81 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 257 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 190 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  40.16 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  34.71 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
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NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
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