More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3018 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  93.21 
 
 		 221 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  79.7 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 205 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  68.56 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 201 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 		 189 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 197 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 189 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 188 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 179 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 188 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 187 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 191 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 174 aa  88.6  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>